解説：

統計調査の調査主体を問う問題である。
国勢調査は我が国の人口状況を明らかにするために実施され、実施しているのは総務省統計局であり、10年ごとの大規模調査とその中間年の簡易調査が行われている。また平成27年の調査では、インターネットによる回答も導入された。
よって、正解は(3)である。

コメント：

(1)の文部科学省では学校基本調査、(2)の経済産業省では鉱工業指数
(4)の内閣府では国民経済計算、(5)の国土交通省では港湾調査などの政府統計を公表している。